INTER ZAPREŠIĆ i Orijent 1919 dobili su licence za nastup u Prvoj HNL sljedeće sezone, odlučilo je tako Žalbeno tijelo za licenciranje nakon što u prvom krugu nisu dobili licencu od Komisije za licenciranje.
Kod Intera su bila sporna financijska dugovanja, posebno prema bivšem treneru Samiru Toplaku koji tvrdi da obveze prema njemu nisu u potpunosti izmirene, ali Inter je dobio licencu.
U slučaju ulaska u Prvu HNL, Orijent će igrati na Rujevici
Orijent je imao problema s infrastrukturnim uvjetima s obzirom na to da stadion na Krimeji kao i Kantrida koju su prijavili kao zamjenski stadion ne zadovoljava uvjete za Prvu HNL.
Na kraju su ipak dobili licencu, ali za Rujevicu na kojoj igra i Rijeka. Orijent će tako kvalifikacije za Prvu HNL igrati protiv devetoplasirane momčadi lige na kraju sezone.
Odbijene žalbe trećeligaša
Kad je Druga HNL u pitanju, licencu su nakon žalbenog postupka dobili aktualni drugoligaši Dugopolje, Solin, Hrvatski dragovoljac i Rudeš, dok su od aktualnih trećeligaša nakon žalbe licencu dobili Marsonia, Mladost Petrinja i Opatija. Prethodno je ista dodijeljena Belišću, Junaku i Lučkom, što znači da će se igrati i kvalifikacije za popunu Druge HNL za sezonu 2020./2021.
Od trećeligaša licencu za Drugu HNL nakon žalbenog postupka nisu dobili Graničar Županja, Jarun, Mladost Ždralovi, Vinogradar, Vrbovec, Zadar i Zrinski Jurjevac.