Već tada su svi mediji o tome šutjeli, a usudili su se nešto napisati tek nakon što je oporba oko afere podigla buku. Mjesecima se pisalo o aferi, oporba je tražila odgovore i tvrdila da ako je to točno onda se radi o velikom sukobu interesa, no u prosincu Povjerenstvo za sukob interesa obavijestilo je javnost kako je Ivo Sanader čist što se tiče Verone. Index je tada objavio komentar s naslovom "S koliko se laži Sanader može nekažnjeno izvući?"
Pet godina kasnije, točnije u studenom 2011. godine počela je istraga oko prodaje Plive Amerikancima.
Iste godine, u svibnju 2006. godine, Index je pisao i o aferi Brodosplit, te ustvrdio kako je napokon posve jasno da je Sanader odlučno pristupio provođenju antikorupcijskog programa. "Na sebi i "reformiranom" HDZ-u svojstven način, naravno., uhljebljujući kriminalce iz stranke kako bi i dalje mogli za njega obavljati prljave poslove.", citat je iz Indexovog teksta.
Ina i Mol: Ili nesposobnost ili velika prevara građana!
U listopadu 2008. godine Index je opet u komentaru napisao sljedeće: "Na kraju, odluka za zamjenom dionica Ine, koja je u usponu, s MOL-om, koji je u padu, a koja je i pokrenula cijelu lavinu oko hrvatske naftne kompanije, u najmanju je ruku sumnjiva, a potpuno je nemoguće "popušiti" Sanaderovu priču o tome kako je tim potezom Vlada htjela osigurati energetske interese Hrvatske. To se sada i pokazuje, MOL je bez ikakve potrebe za zamjenom dionica došao do jednakog broja dionica kao i država, tako da je u prednosti u bilo kakvim daljnjim dogovorima. Dakle, u najmanju ruku radi se o nesposobnosti, a u najgorem slučaju o direktnoj prevari građana."
U međuvremenu je Index pisao i o Sanaderovim satovima, umjetninama, i drugim manjim aferama koje su se spominjale oko Ive Sanadera.
Sanaderov BMW
U ožujku 2009. godine Index je otkrio kako je Sanader kupio blindirani BMW za 4,187.595,00 kuna, te kao dokaz priložio račun za automobil. Istraga oko afere BMW je u tijeku, istražuje se tko je i kako za Sanaderov BMW iskeširao 4,2 milijuna kuna , a u igri su svi od blagajne HDZ-a do donatora - poduzetnika. Sanaderova Vlada tvrdila je tada da Index, koji je tražio objašnjenje i ispriku HDZ-a javnosti, laže, no događaji nakon toga i istraga Uskoka pokazala je da Index posjeduje autentičan račun.
Index je nastavio pisati o Sanaderovim aferama i nakon što je naprasno otišao s vlasti.
Sanader i Ježić
U svibnju 2010. godine Index je otkrio novu veliku aferu u kojoj su glavni akteri Ivo Sanader i Robert Ježić. Naime, Dioki u većinskom vlasništvu Roberta Ježića uspio je, svega nekoliko dana prije odlaska premijera Ive Sanadera, prodati malo i zastarjelo skladište na zagrebačkom Žitnjaku državnoj tvrtki Jadranski naftovod (Janaf) i to za 18 milijuna eura iako su skladišta bila procijenjena na svega 5 do 6 milijuna eura. Godinu dana kasnije započela je istraga i oko tog slučaja, u kojoj Uskok sumnjiči Sanadera i Ježića da su zlorabeći položaj oštetili za deset milijuna eura JANAF-a, a zbog kupnje skladišta na Žitnjaku.
U lipnju 2010. godine Index je dobio informacije kako istraga oko afere Hypo Austrijance vodi prema Sanaderu i Graniću te da se istražuje jesu li hrvatski dužnosnici uzimali novac za posredovanje u poslovanju Hypo banke u Hrvatskoj. Jučerašnjom presudom, Indexova vijest od prije skoro dvije pol godina dobila je svoju potvrdu.
Index je u rujnu 2010. godine objavio i crnu knjižicu Miroslava Kutle, u kojoj se nalaze i inicijali Ive Sanadera, ustvrdila je to Milena Šenator, bivša direktorica Kutlina Globus Holdinga.
Bilo je još puno toga što je Index pisao o Sanaderu za vrijeme dok je bio na vlasti. Dok su svi drugi šutjeli.